基因差异如何表达? 什么是差异表达基因

时间:2021-09-21 作者:admin 98857
什么是差异表达基因

基因差异如何表达?

基因差异火山图看法如下:火山图可反映总体基因的表达情况,横坐标代表log2(FoldChange),纵坐标表示-log10(P值),每个点代表一个基因,颜色用以区分基因是否差异表达,图中橙色的点代表差异表达基因,蓝色的点代表没有差异表达的基因。聚类图聚类图可以衡量样本或基因之间表达的相似性。在聚类图中,横坐标代表样本聚类,一列代表一个样本,聚类基于样本间基因表达的相似性,样本间基因表达越接近,靠的越近,以此类推。纵坐标代表基因聚类,一行代表一个基因,聚类基于基因在样本中表达的相似性,基因在样本中表达越接近,靠的越近,以此类推。色阶代表基因表达丰度,越红代表上调得越明显,越绿代表下调得越明显。

怎么判断差异表达的基因?

判断差异表达的基因常用的分析方法有三类,第一类称之为倍数分析,计算每一个基因在两个条件下的Ratio值,若大于给定阈值,则为表达差异显著的基因第二类方法采用统计分析中的t检验和方差分析,计算表达差异的置信度,来分析差异是否具有统计显著性第三类是建模的方法,通过确定两个条件下的模型参数是否相同来判断表达差异的显著性,例如贝叶斯方法。

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